元代建顺元城，其北门在今勇烈路与中华中路相接处。明洪武十五年（1382年）改土城为石城，并把北门扩展到今喷水池一带，全城有门五孔，东为武胜门（民国时改名禹门，俗称老东门），西为圣泉门（民国时改名中山门），俗称大西门，北为柔远门（俗称北门，今喷水池）。明熹宗天启六年（1626年）增筑外城，有门四孔，东为小东门（新东门），东北为洪边门，北为六广门，西为威清门，新旧两城共有城门九孔，七孔在今云岩区境。本世纪40年代后陆续拆除，但至今人们仍以各城门名称表示方位。明代贵州建省以后，云岩区境为贵州历代行政机关驻地。明永乐十一年（1413年）建贵州布政司，永乐十八年（1420年）建按察使司，清王朝亦沿袭。民国时期省政府等均区境。

    云岩区境，元属顺元宣慰司，明初隶贵州宣慰司，隆庆三年（1569年）建贵阳府后，区境为附郭。万历十四年（1586年）置新贵县，区境为附郭。清康熙二十六年（1687）置贵筑县，区境属红边、西上、南隅三里。乾隆十四年（1749年）改贵阳府附郭，区境属内城东北保、西北保及外城西南保、东南保、西北保。民国3年（1914年）置贵阳县，区境隶之。民国9年（1920年）设乡，区境隶贵山、雅关等6乡。民国19年（1930年）改9个区，其中6个区辖今区境。民国30年（1941年）置贵阳市，民国32年（1043年）设镇，今区境有13个镇。民国33年（1944年）改为区，其中一、二、三、七、九区辖今区境。1949年11月15日贵阳市解放，1950年5月将接管的9个区调为7个区。一、二、七区及六区一部分在今区境。1952年五、六、七区合并为郊区，下设5个乡，其中二、三、四乡在今区境。1955年，改一、二区为云岩区、富水区。1958年，云岩、富水两区合并为云岩区。云岩区人民政府驻地设在毓秀路。2003年迁往大营坡。2003年全区共15个街道办事处，1个镇，113个社区居民委员会，13个村民委员会。2009年全区共18个街道办事处，1个镇，134个社区居民委员会，19个村民委员会。 2012年，全区共1个镇、26个社区服务中心（即黔灵镇、中东、东山、头桥、金龙、市西、威清、延中、黔东、栖霞、宅吉、省府、中环、中华、贵乌、金狮、中天、三桥、圣泉、普陀、北京、金惠、金鸭、荷塘、普天、金关、蔡关等社区服务中心）。全区土地总面积93.57平方千米，其中，城区土地面积12.4平方千米。常住人口约95万人，流动人口约30万余人，农业人口3万余人。